1、亚磷酸三甲酯是一种重要的有机磷农药的中间体，用于生产敌敌畏、磷胺、久效磷、杀虫畏等杀虫剂农药。也是制作新型有机磷阻燃剂的主要材料。以及用作合成聚合催化剂及涂料添加剂。 

2、膦酸酯或磷酸酯类化合物的合成：亚磷酸三甲酯是一种非常有用的磷试剂，它可以与卤代烃发生Arbuzov重排反应和Perkow反应，分别生成相应的膦酸酯和烯醇的磷酸酯类化合物。